Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 RN7SL251P-201ENST00000464175 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RELBQ01201 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
RELBQ01201 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
RELBQ01201 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RELBQ01201 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RELBQ01201 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RELBQ01201 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RELBQ01201 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RELBQ01201 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RELBQ01201 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RELBQ01201 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RELBQ01201 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RELBQ01201 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RELBQ01201 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RELBQ01201 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RELBQ01201 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RELBQ01201 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RELBQ01201 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RELBQ01201 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RELBQ01201 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms