Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TMPOP42166 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TMPOP42166 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TMPOP42166 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TMPOP42166 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TMPOP42166 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TMPOP42166 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TMPOP42166 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TMPOP42166 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TMPOP42166 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TMPOP42166 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TMPOP42166 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TMPOP42166 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TMPOP42166 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TMPOP42166 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TMPOP42166 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TMPOP42166 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TMPOP42166 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms