Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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