Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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