Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ZBED1O96006 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms