Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
HOXA2O43364 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXA2O43364 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms