Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AL354733.2-202ENST00000615485 742 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 FLT1-208ENST00000617835 434 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 snoMe28S-Am2634.2-201ENST00000637869 80 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ESRRG-221ENST00000493603 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MAGOH-201ENST00000371466 500 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 HMGB3P1-201ENST00000393368 573 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC103563.8-201ENST00000415716 318 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC004129.1-201ENST00000417617 796 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MYB-206ENST00000420123 1051 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL592043.2-201ENST00000454146 743 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL357874.2-201ENST00000457044 679 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RN7SL854P-201ENST00000459767 295 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RN7SL251P-201ENST00000464175 297 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 DAZAP2P1-201ENST00000475212 503 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 SLA-223ENST00000524345 1003 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AP001767.1-201ENST00000530976 286 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC073571.1-201ENST00000549103 475 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC023813.3-201ENST00000561876 539 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ZNF286A-214ENST00000581529 560 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CSH1-206ENST00000610991 580 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC244093.2-201ENST00000620102 524 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.1 ms