Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CSPP1Q1MSJ5 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms