Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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