Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
ZNF56Q15929 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF56Q15929 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF56Q15929 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF56Q15929 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF56Q15929 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF56Q15929 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF56Q15929 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF56Q15929 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF56Q15929 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF56Q15929 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF56Q15929 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF56Q15929 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF56Q15929 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms