Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 C17orf80-208ENST00000582793 531 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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