Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
MTMR3Q13615 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms