Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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