Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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FOXD4Q12950 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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