Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 BDNF-206ENST00000395983 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 SLC22A9-201ENST00000279178 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AL353807.3-201ENST00000500626 2505 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 GOSR2-238ENST00000640495 3395 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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FOXC1Q12948 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 SLC22A10-201ENST00000332793 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 C4BPA-201ENST00000367070 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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FOXC1Q12948 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 GPBP1L1-201ENST00000290795 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 IL31RA-203ENST00000359040 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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FOXC1Q12948 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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FOXC1Q12948 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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FOXC1Q12948 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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