Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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PTPRCP08575 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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PTPRCP08575 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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