Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms