Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP31Q70CQ4 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms