Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms