Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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SGCAQ16586 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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SGCAQ16586 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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SGCAQ16586 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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