Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VPS72Q15906 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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