Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms