Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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