Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F1Q01094 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms