Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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PTPRBP23467 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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PTPRBP23467 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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PTPRBP23467 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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PTPRBP23467 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
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