Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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