Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms