Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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SH3BP4Q9P0V3 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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SH3BP4Q9P0V3 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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