Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 LYNX1-207ENST00000523332 600 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC02396-203ENST00000551922 525 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AL049634.2-203ENST00000564763 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 C17orf62-220ENST00000580560 564 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 MIR3185-201ENST00000583892 68 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 RPIAP1-201ENST00000587900 742 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF544-204ENST00000595981 895 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 SPRY4-IT1_1.1-201ENST00000611334 91 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 MIR6831-201ENST00000617240 81 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 WT1-AS_1.1-201ENST00000619639 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 HTT-AS1_2.1-201ENST00000621529 175 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AL139351.1-201ENST00000622092 320 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AC135068.9-201ENST00000628927 355 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 CFAP45-202ENST00000426543 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 BIN2-202ENST00000544402 1990 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 STAC2-201ENST00000333461 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 SULF1-223ENST00000616868 3381 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 RIPOR1-201ENST00000042381 4051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 IKBKB-230ENST00000629753 4069 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF587-201ENST00000339656 6882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AL138889.1-202ENST00000451317 3630 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ABL2-211ENST00000512653 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC16A1-AS1-204ENST00000428411 8757 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 TRPV3-205ENST00000572519 2937 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 MYO18B-205ENST00000536101 8051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 MYH13-201ENST00000252172 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 CFAP65-202ENST00000341552 5953 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 DDR1-239ENST00000452441 3857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 HNRNPA1-203ENST00000546500 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF790-208ENST00000615484 2451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 NLRP1-202ENST00000269280 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 OR8G1-202ENST00000641972 5055 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 PTGIS-201ENST00000244043 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 RUNX1T1-250ENST00000614812 7483 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ACTN2-201ENST00000366578 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 IRS4-201ENST00000372129 3928 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 RNF207-201ENST00000377939 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 LYPD4-203ENST00000609812 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ARHGEF15-201ENST00000361926 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 JUP-201ENST00000310706 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 CFAP43-202ENST00000357060 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ATG16L1-205ENST00000392020 3213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 GRIK1-204ENST00000399907 3472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AC005481.1-201ENST00000409610 3456 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 NRP1-201ENST00000265371 5882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 EDAR-201ENST00000258443 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 DLAT-201ENST00000280346 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 CD22-204ENST00000536635 3004 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 COL14A1-203ENST00000309791 6163 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AP2A1-202ENST00000359032 3286 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 RAPGEF3-219ENST00000549151 3265 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 TBX15-202ENST00000369429 3504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 PHF21B-202ENST00000396103 3540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ATXN7L3-202ENST00000454077 3523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 OR2T10-202ENST00000642090 3519 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF423-207ENST00000567169 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC01588-208ENST00000554129 2301 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 NCOA4-201ENST00000578454 2307 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 CA13-201ENST00000321764 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 FNIP1-203ENST00000510461 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF569-201ENST00000316950 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 BDNF-201ENST00000314915 4340 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms