Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms