Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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SGCBQ16585 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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SGCBQ16585 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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SGCBQ16585 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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SGCBQ16585 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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SGCBQ16585 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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