Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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