Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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VAMP3Q15836 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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VAMP3Q15836 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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VAMP3Q15836 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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VAMP3Q15836 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
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VAMP3Q15836 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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VAMP3Q15836 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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VAMP3Q15836 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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VAMP3Q15836 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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