Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms