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| BRD3 | Q15059 | RNU1-106P-201 | ENST00000384382 | 164 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | DNAJA1P4-201 | ENST00000406473 | 1166 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | DPPA2P3-201 | ENST00000411853 | 655 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | HRH4-202 | ENST00000426880 | 909 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC020891.3-201 | ENST00000560011 | 363 nt | TSL 3 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC106745.1-201 | ENST00000566798 | 464 nt | TSL 2 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC007952.9-201 | ENST00000584365 | 191 nt | TSL 3 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | Z98949.1-211 | ENST00000596813 | 773 nt | TSL 5 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC243773.3-201 | ENST00000613270 | 256 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC079395.3-201 | ENST00000615161 | 484 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR52N4-202 | ENST00000641350 | 1276 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC02431-201 | ENST00000503929 | 3601 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | CARF-203 | ENST00000414439 | 2099 nt | TSL 2 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL390862.1-201 | ENST00000635467 | 1469 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | PCDH11X-205 | ENST00000373094 | 9179 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | NUP58P1-201 | ENST00000502546 | 1738 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTX3-203 | ENST00000512560 | 4799 nt | TSL 2 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR2H1-202 | ENST00000377133 | 3021 nt | APPRIS P1 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | SLC17A4-201 | ENST00000377905 | 3616 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | MS4A1-201 | ENST00000345732 | 3331 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC004057.1-202 | ENST00000356247 | 284 nt | TSL 3 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
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| BRD3 | Q15059 | RNA5SP104-201 | ENST00000410989 | 118 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL591468.1-201 | ENST00000417932 | 573 nt | TSL 3 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTCO2P21-201 | ENST00000419780 | 677 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC092832.1-201 | ENST00000422934 | 400 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | NAALADL2-AS2-201 | ENST00000424690 | 1038 nt | TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC02238-201 | ENST00000424953 | 557 nt | TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | OFD1P12Y-201 | ENST00000427963 | 1207 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | OFD1P13Y-201 | ENST00000431179 | 1232 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC010132.1-201 | ENST00000433315 | 561 nt | TSL 4 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | PCDH9-AS3-201 | ENST00000434073 | 479 nt | TSL 2 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTND3P1-201 | ENST00000441336 | 220 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP000146.1-202 | ENST00000441666 | 441 nt | TSL 3 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC096644.1-201 | ENST00000446169 | 390 nt | TSL 3 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | snoU13.3-201 | ENST00000459441 | 104 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC026410.2-201 | ENST00000460281 | 156 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
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| BRD3 | Q15059 | RNU6-583P-201 | ENST00000516012 | 92 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC104986.1-201 | ENST00000517978 | 436 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | TRIQK-209 | ENST00000519969 | 555 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC090802.1-201 | ENST00000520870 | 445 nt | TSL 2 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC113192.5-201 | ENST00000528779 | 486 nt | TSL 2 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
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| BRD3 | Q15059 | KIRREL3-AS2-201 | ENST00000532988 | 492 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNHG1-204 | ENST00000537068 | 629 nt | TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC025263.2-201 | ENST00000550437 | 548 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC087465.1-201 | ENST00000560574 | 245 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC02126-202 | ENST00000563754 | 750 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC055855.3-201 | ENST00000564269 | 578 nt | TSL 2 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | MMP2-AS1-201 | ENST00000565307 | 593 nt | TSL 4 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01859-201 | ENST00000565584 | 1024 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL512347.1-201 | ENST00000566420 | 503 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC079171.1-201 | ENST00000568788 | 914 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC007495.1-203 | ENST00000569025 | 888 nt | TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC010551.2-201 | ENST00000569200 | 416 nt | TSL 3 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR4637-201 | ENST00000582405 | 84 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL38-208 | ENST00000584577 | 344 nt | APPRIS ALT1 TSL 3 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC008638.3-201 | ENST00000603341 | 463 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC016747.2-201 | ENST00000605902 | 364 nt | TSL 2 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL121612.2-201 | ENST00000612261 | 482 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | CENPI-201 | ENST00000372926 | 2375 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | EEF1A1P36-201 | ENST00000427807 | 1351 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | EMCN-209 | ENST00000511970 | 1377 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL391684.1-202 | ENST00000641293 | 1636 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | KLHL13-203 | ENST00000371878 | 3234 nt | TSL 2 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | ABCA12-201 | ENST00000272895 | 9100 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | RABGAP1L-203 | ENST00000347255 | 1744 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC005539.1-201 | ENST00000443768 | 1479 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | MACF1-231 | ENST00000564288 | 24828 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | PNPLA8-204 | ENST00000426128 | 4268 nt | TSL 5 BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |