Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms