Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms