Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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ITGA9Q13797 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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ITGA9Q13797 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
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ITGA9Q13797 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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ITGA9Q13797 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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ITGA9Q13797 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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ITGA9Q13797 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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ITGA9Q13797 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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ITGA9Q13797 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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ITGA9Q13797 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
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