Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms