Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms