Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms