Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SNORA68-201ENST00000384437 133 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
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