Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.1 ms