Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 DET1-202ENST00000444300 2154 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 ZNF674-207ENST00000523374 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 ZNF611-204ENST00000543227 4517 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 HMCN2-206ENST00000624552 15610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 LINC02209-201ENST00000521245 2651 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 OSBPL6-202ENST00000315022 2999 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 CFAP61-205ENST00000377306 2017 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 RN7SKP119-201ENST00000410753 273 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 ZEB2-AS1-201ENST00000421083 453 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 TRBV10-2-201ENST00000426318 395 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 AL135929.1-201ENST00000449287 552 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 AL122013.1-201ENST00000473054 801 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 RN7SL862P-201ENST00000491550 298 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 LINC01588-202ENST00000528300 3208 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 AC005230.1-201ENST00000555418 285 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 AC123788.2-201ENST00000612290 283 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 RIOK2-201ENST00000283109 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 ZNF200-203ENST00000396871 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 PART1-203ENST00000515734 2569 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 ARHGAP42P2-201ENST00000416089 2140 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 ZNF10-202ENST00000402932 1967 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 GRIA2-201ENST00000264426 3445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 C9orf131-201ENST00000312292 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 AC106800.1-201ENST00000501221 1362 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 NFRKB-203ENST00000524794 4351 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CACNB1Q02641 DNAJC5G-202ENST00000402462 1904 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
CACNB1Q02641 GTF2H2-201ENST00000274400 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
CACNB1Q02641 DCX-201ENST00000356220 3019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 AMPD3-204ENST00000444303 3994 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 AMYH02020865.1-201ENST00000621140 2591 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 RABGEF1-203ENST00000439720 3065 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 DEFB124-201ENST00000317676 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 MED15P8-201ENST00000411601 545 ntBASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 HMGN2P24-201ENST00000433516 273 ntBASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 AC098828.1-201ENST00000436164 440 ntBASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 KDM4A-AS1-205ENST00000453015 647 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 RN7SL740P-201ENST00000467060 344 ntBASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 RN7SL445P-201ENST00000495609 293 ntBASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 AC068014.1-201ENST00000576836 413 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 AC018521.6-201ENST00000584276 335 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 SMG1P1-202ENST00000309865 4223 ntBASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 ZNF845-202ENST00000595091 4413 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 IRAK4-214ENST00000613694 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
CACNB1Q02641 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.6 ms