Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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