Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MAP3K4Q9Y6R4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms