Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms