Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARRES3Q9UL19 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms