Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms