Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms