Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms